Църквата „Свети 40 мъченици" била построена, украсена и стенописана no заповед на цар Иван Асен II и посветена на голямата му победа при Клокотница на 9 март 1230 год. над епирския деспот кир Теодор Комнин. През XIII—XIV век е била една от най-хубавите и най-богати църкви на манастира, наричан "Велика лавра".